水箱清洗完了不代表水管内留存的水是干净的，最好是放一段时间等水管内的水放尽了，水箱内的水才能流进管子里，相对来讲这时候的水是干净的。
小区二次供水水箱如何清洗消毒呢?1、工具的准备。
工作服、扫把、尼龙刷、铁铲、高压水枪、杀菌药物、安全照明灯具、水泵、鼓风机、口罩、眼镜等。
2、安全知识。
(1)、电源：水箱水池内作业电源要用隔离变压器变为36V以下安全电压作为工作照明，最好用手电、应急灯，三相水泵要装有漏电开头。
(2)、缺氧;有些水箱水池长期封闭，空气流通差，可在不锈钢水箱口处连接鼓风机吹风，约3小时通风时间，然后选用如下试验：把燃着的蜡烛放入水池，如不熄灭说明水池内不缺氧。否则须继续通风直到没问题为止。
3、注意事项。
在清洗不锈钢水箱的过程中，消毒人员须带护眼镜、口罩，如在水箱内感到身体不适，产生头晕、眼睛酸痛、心闷、气紧，要马上离开水池，用清水冲洗眼睛，呼吸新鲜空气即可恢复。除杂物和清池时，先用铁铲铲出池内泥砂及各种沉积物，然后用扫把或尼龙刷从水池(箱)的顶部——四周墙壁——水池(箱)底顺序，依次反复刷洗。刷洗完毕用高压水枪整体冲洗一遍，排出污水。
4、杀菌。
(1)、用1100的灭菌净(一般为漂白精粉)水溶液进行消毒，用扫把或尼龙刷依次反复刷洗杀菌，并将水池(箱)盖好，封闭半小时后排出消毒水。
(2)、水箱内注入适量自来水，用清水将上述位置反复清洗，冲洗出杀菌药水。
(3)、注水：在清洗工作彻底完成后，开闸向水池(箱)注水，达到标定的水位高度，并加盖加锁。
