关于光绪皇帝的死因，按当时清王朝的官方说法是“病死”。然而，对于真正的死因，一直有多种猜测。

其中最多的猜测是谋杀：有清宫老太监回忆，光绪是吃了袁世凯送来的一副药暴毙的；还有人推测说，是大太监李莲英下的毒手；还有人说，是太监崔玉贵行凶。

直到100年后，在对光绪尸体留存的头发，进行了科学鉴定后发现：光绪头发中的砷含量是同时代隆裕皇后的261倍。

在排除了诸多外因之后，学者们得出结论：光绪皇帝死于急性三氧化二砷中毒，也就是俗称的砒霜中毒，而且是吃下去的药物或食物含有砒霜。

后世虽然可以通过法医鉴定确认死因，但是谁是行凶者？到目前为止，学界还没有定论。

然而，无论直接凶手是谁，慈禧太后都不可能置身事外。因为她在去世之前，始终牢牢把持着紫禁城的控制权，如果没有慈禧太后的点头甚至默许，谋杀根本无法实现，甚至一行动就会败露。

谋杀第一步：放风铺垫

在戊戌变法失败、光绪皇帝遭到软禁之后，大权在握的慈禧太后，就动过杀掉光绪的念头。

在1898年，慈禧太后宣布“训政”并捕杀维新人士，同时她以光绪的名义发布旨意，称：光绪皇帝久病不愈，太医束手无策，想邀请各地名医前来给皇帝诊治。

这是一道暗藏杀机的旨意：光绪皇帝久病不愈，且太医医治无效，要是外面名医也治不好呢？下一步，光绪就可以很自然的“被病死”了！

后来，因为海内外商人华侨的联名质疑，多国外交人员质询，再加上张之洞、刘坤一等封疆大吏劝说，慈禧太后就暂时放弃了谋杀计划。

谋杀第二步：控制医疗

外界猛烈的舆论反弹，只能让慈禧太后的杀意暂时停止，她并没有放弃谋杀计划。

1898年放出风声之后，两江总督刘坤一，推荐名医陈秉钧为光绪皇帝诊病。结果看病的全过程，都被慈禧太后牢牢控制。诊病时，陈秉钧跪的距离很远；询问光绪的患病症状，全由慈禧太后代答；所谓的诊脉，也成了虚按。

当时慈禧太后想干什么，陈秉钧自然心中雪亮，随后就花钱请托，直接跑路了。

谋杀第三步：部署人员

经过前两步的铺垫，光绪皇帝的性命已在慈禧太后的掌握之中。清廷内部都有很多人知道：慈禧太后绝不容许光绪皇帝死在她后面。

一切都准备就绪，部署好了下手行凶的人员，只等慈禧太后这边出状况了，就开始这个谋杀行动。

光绪死前十天，曾经步行去向慈禧太后请安。但是慈禧太后拒绝见光绪皇帝，并发出了一道奇怪的懿旨：因皇帝卧病在床，免礼。

还能走路的光绪皇帝，就这样被慈禧太后正式宣布“卧病在床”了。当时的光绪皇帝听了这道懿旨，脸色大变，恐怕他也明白了太后的杀意。

谋杀第四步：发动之时

当时的宫廷内部，已经被匪夷所思的气氛所笼罩。大家盛传，太后已经对光绪放出话来：“我不能先你而死。”

这传言的源头，恐怕就是接受命令的行凶之人。著名书法家启功曾经回忆：他的曾祖父礼部尚书溥良，曾亲眼看到一个太监，端着一碗皇太后钦赐的酸奶，去给光绪皇帝喝。之后不久，光绪皇帝就死了。

谋杀第五步：销毁证据

清朝太医为皇帝诊病，是有脉案记录的，而恰恰是光绪皇帝死前这四天的脉案，有空白缺漏。清朝有专门的起居注官，负责记录皇帝每天的行踪，同样是这几天，其内容明显与其他资料记载的情况不符。

光绪皇帝死后入殓事宜，按旧例应由内务府操办，但这一次却全部由宫内太监负责。这些粗糙的掩盖行为，显得有些欲盖弥彰。但此时慈禧太后也已经死亡，谋杀皇帝一事收尾粗糙，她也管不了了。

慈禧太后肯定没有想到，这一场宫斗之后不过两年，清王朝的丧钟就正式敲响了。紫禁城中这一场你死我死的宫斗，不过是中国2000年封建王朝统治彻底崩溃时，一个骇人听闻的小注解而已。